Assistant de recherche en biologie expérimentale et computationnelle 55 %

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Vos responsabilités

• Contribuer aux travaux expérimentaux et aux mesures basées sur la microscopie de structures 3D en utilisant la microscopie confocale à disque rotatif et la microscopie à feuille de lumière pour des ensembles de données multiplexés fixes et d'imagerie en direct.
• Analyser les mesures multiplexées et intégrer les caractéristiques dérivées de l'imagerie pour étudier le comportement cellulaire.
• Traiter les données de microscopie à feuille de lumière et appliquer des flux de travail pour le suivi des cellules dans des ensembles de données d'imagerie en direct.
• Appliquer des méthodes computationnelles, y compris l'apprentissage automatique le cas échéant, pour identifier des modèles et extraire des informations biologiques.
• Effectuer le contrôle de la qualité des données, l'analyse statistique et la visualisation.
• Travailler en étroite collaboration avec des chercheurs expérimentaux et computationnels et documenter les expériences, le code, les méthodes et les résultats.

Votre profil

• Master (MSc) en biologie cellulaire, biologie du développement, ingénierie ou une discipline connexe, avec une combinaison d'expérience expérimentale et computationnelle.
• Expérience en codage Python et capacité à développer et adapter des scripts pour l'analyse de données scientifiques.
• Connaissance de la microscopie et de l'analyse d'images, avec la capacité de relier les mesures expérimentales à des questions biologiques quantitatives.
• Expérience en analyse de données quantitatives et intérêt pour les flux de travail computationnels reproductibles.
• Une expérience de travail avec des embryons est un avantage. La familiarité avec la microscopie à feuille de lumière, le suivi cellulaire, les mesures multiplexées ou les ensembles de données volumétriques volumineux est également la bienvenue.
• Fortes compétences en communication, maîtrise de l'anglais et capacité à travailler de manière indépendante et à collaborer entre disciplines.

Dr. Shayan Shamipour
SNF Ambizione Fellow
+41782442377
Dr. Shayan Shamipour